雌、雄弓背青鳉(Oryzias curvinotus)肝脏转录组比较分析

作者：董忠典,黎学友,廖健,张宁,郭昱嵩,王中铎

摘要：为发掘弓背青鳉(Oryzias curvinotus)肝脏功能基因、开发环境检测标记基因,本研究采用RNA-Seq技术分别测定了性成熟雌、雄弓背青鳉肝脏转录组,并获得80095044和87043984条clean reads,合并拼接出49912个unigenes(N50=2394bp)。基因表达差异分析显示在雌、雄弓背青鳉肝脏组织中存在571个差异基因(DEGs),其中364个在雄鱼中高表达,207个在雌鱼中高表达。GO和KEGG分析表明差异基因主要参与激素合成、免疫反应、氧化还原反应及卵黄发生等生物学过程。进一步,在转录组中筛选到了多个环境雌激素相关标记基因(vtgs,chgs,er,cyp450等),且这些基因在雌鱼肝脏中的表达水平显著高于雄鱼。研究结果丰富了弓背青鳉的基因资源,为研究基因功能提供了数据,也有助于进一步研究鱼类肝脏在不同性别之间的功能。

发文机构：广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖重点实验室

关键词：弓背青鳉肝脏转录组测序差异基因生物标志物Oryzias curvinotuslivertranscriptome sequencingdifferentially expressed genesbiomarker

分类号： S917.4[农业科学—水产科学]