利用高通量测序技术分析鱼菜共生池塘的真菌多样性和群落结构

作者：孟玮,高攀,翟旭亮,胡建勇,杨天燕,李晓东,时春明

摘要：本文采集了位于新疆水生野生动物救护中心和乌鲁木齐市米东区长山子镇水源地养殖基地的鱼菜共生池塘水样及水培空心菜根系,基于Illumina HiSeq 2500高通量测序平台对上述样本的宏基因组ITS基因序列进行了测定和分析。在6份样品(4份水体样品、2份根系样品)中,共检测到78348条平均长度为256 bp的有效序列,这些真菌包括了6个门、25个纲和72个目。不同地点、不同样品类型间的真菌微生物群落存在明显差异,隶属于子囊菌门(Ascomycota)锤舌菌纲(Leotiomycetes)白粉菌目(Erysiphales)白粉菌科(Erysiphaceae)的菌群为根系样品所特有。乌鲁木齐市米东区长山子镇水源地养殖基地鱼菜共生池塘的空心菜根系真菌的Alpha多样性指数均最高,相应的对照池塘真菌多样性组成则最低。Beta多样性指数表明,乌鲁木齐市米东区长山子镇水源地养殖基地水样和新疆水生野生动物救护中心空心菜根系真菌组成差异最大。从蔬菜长势情况来看,乌鲁木齐市米东区长山子镇水源地养殖基地鱼菜共生池塘明显好于新疆水生野生动物救护中心,推测其原因为:前者水体中真菌种类和数量较多,特有菌类(如石黄衣、酵母菌)能够改善水质、提供动植物生长繁殖的养分。

发文机构：浙江省海洋水产研究所 新疆维吾尔自治区水产科学研究所 重庆市水产技术推广总站 乌鲁木齐市百汇鱼生渔业科技有限公司 浙江海洋大学水产学院

关键词：鱼菜共生新疆高通量测序真菌多样性群落结构aquaponicsXinjianghigh-throughput sequencingfungus diversitycommunity structure

分类号： S964.3[农业科学—水产养殖]