iPath在生物海洋学中的应用

作者：舒王欣泽,孙军

摘要：iPath是一个用于细胞路径可视化和代谢途径分析的免费网页应用程序。iPath中的路径是通过交互式浏览器查看的,它提供各种代谢途径的直接导航,使人们能够方便地访问相关的化合物和酶。本文简要介绍了最新的iPath3.0版本(http://pathways.embl.de)(基于4个KEGG的全局地图,158个传统的KEGG路径图,192个KEGG模板,以及其他代谢元素,组成了一个相互连接、手工绘制的代谢网络),并举例说明其在生物海洋学研究中的应用,以期引起国内学者对此工具的重视,促进其在生物海洋学研究中的应用。

发文机构：山东大学海洋研究院 天津科技大学印度洋生态系统研究中心

关键词：iPath代谢途径可视化KEGG路径组学iPathmetabolic pathwaysvisualizationKEGG pathwayomics

分类号： Q819[生物学—生物工程]